Pouilley-les-Vignes est cerné de collines dont la plus caractéristique est le Mont de Pouilley qui constitue un véritable écrin vert au-dessus du village. Il y subsiste les vestiges d’un ancien château du XIIIe siècle et de bastions militaires du XIXe siècle.
L’Église Saint-Aubin, déjà existante au Xe siècle, a bénéficié d’une restauration remarquable. Elle abrite des œuvres d’art très intéressantes.
Pouilley dérive à priori de pouille, nom d'un écritoire sur lequel on notait autrefois les récoltes (de raisin dans le cas présent).